Identifican nueva variante del virus Sars-CoV-2 en tres estados

Agencia Brasil- Se ha detectado en Brasil una cepa del virus SARS-CoV-2 que se ha propagado por todo el mundo. La cepa, denominada XEC y perteneciente a la variante Ómicron, se identificó en Río de Janeiro, São Paulo y Santa Catarina. El primer descubrimiento lo realizó el Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz) en muestras de dos pacientes residentes en la capital del estado, diagnosticados con COVID-19 en septiembre. La identificación fue realizada por el Laboratorio de Virus Respiratorios, Virus Exantematosos, Enterovirus y Emergencias Virales del IOC, que sirve de referencia para el SARS-CoV-2 al Ministerio de Salud y a la Organización Mundial de la Salud (OMS).

El Ministerio de Salud y las Secretarías de Salud Estatal y Municipal de Río de Janeiro fueron informados rápidamente del descubrimiento. Las secuencias genéticas decodificadas se depositaron en la plataforma. en línea Gisaid el 26 de septiembre y el 7 de octubre. Después de las secuencias de Río de Janeiro, otros grupos de investigadores también depositaron genomas del linaje XEC decodificado en São Paulo, a partir de muestras colectadas en agosto, y en Santa Catarina, a partir de dos muestras colectadas en septiembre.

Monitoreo

La OMS clasificó la XEC el 24 de septiembre como variante bajo vigilancia. Esto ocurre cuando un linaje presenta mutaciones en su genoma que se sospecha que afectan el comportamiento del virus y se observan los primeros indicios de una "ventaja de crecimiento" sobre otras variantes circulantes. Esta variante comenzó a llamar la atención en junio y julio de 2024, debido al aumento de las detecciones en Alemania. Se extendió rápidamente por Europa, América, Asia y Oceanía. Al menos 35 países han identificado la cepa, con más de 2,4 secuencias genéticas depositadas en la plataforma Gisaid hasta el 10 de octubre de este año.

Según Paola Resende, investigadora del Laboratorio de Virus Respiratorios, Virus Exantematosos, Enterovirus y Emergencias Virales del COI, datos internacionales indican que la XEC podría ser más transmisible que otras cepas, pero será necesario evaluar su comportamiento en Brasil. "En otros países, esta variante ha mostrado signos de mayor transmisibilidad, lo que incrementa la circulación viral. Es importante observar qué sucederá en Brasil. El impacto de la llegada de esta variante podría no ser el mismo aquí, ya que la memoria inmunológica de la población es diferente en cada país, debido a las cepas que han circulado en el pasado", explica Resende, quien también trabaja en la Red Genómica de Fiocruz.

La detección de XEC en Brasil se logró mediante una estrategia de vigilancia que amplió la secuenciación genómica del SARS-CoV-2 en la capital del estado durante agosto y septiembre. Esta iniciativa se realizó en colaboración con la Secretaría Municipal de Salud de Río de Janeiro. Se recolectaron muestras durante tres semanas. torunda Hisopado nasal para su envío al Laboratorio de Referencia del COI/Fiocruz en casos positivos de SARS-CoV-2 diagnosticados mediante pruebas rápidas en unidades de atención primaria. Si bien el seguimiento reveló la presencia de XEC, confirmó el predominio del linaje JN.1, mayoritario en Brasil desde finales del año pasado.

"Tomamos esta medida para comprender en tiempo real la situación en Río, ya que se registró un ligero aumento de diagnósticos de COVID-19 en la ciudad. Esto fue crucial para detectar la variante XEC, que será necesario monitorear de ahora en adelante", explicó el virólogo.

Los datos actuales de la Secretaría Municipal de Salud de Río de Janeiro e Infogripe, una organización de Fiocruz, no indican un aumento de casos de COVID-19 en la ciudad. El virólogo advierte sobre el debilitamiento de la vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Brasil y refuerza la necesidad de un seguimiento continuo a nivel nacional.

"Actualmente, no contamos con datos genómicos de varios estados porque no se han recolectado muestras ni se han enviado para secuenciación genética. Es crucial que este monitoreo se mantenga uniformemente en todo el país para rastrear el impacto de la llegada de la variante XEC y detectar otras variantes que podrían alterar el panorama de la COVID-19", enfatizó Paola.

El virólogo también enfatizó que los datos sobre los genomas circulantes del SARS-CoV-2 son relevantes para ajustar la composición de las vacunas contra la COVID-19. La OMS cuenta con un grupo asesor técnico sobre el tema, que se reúne dos veces al año. En abril, el comité recomendó formulaciones de vacunas basadas en el linaje JN.1. La próxima reunión está programada para diciembre.

Fuente

Los análisis indican que la XEC surgió mediante recombinación genética entre cepas previamente circulantes. Este fenómeno ocurre cuando un individuo se infecta simultáneamente por dos linajes virales diferentes. En este caso, los genomas de ambos patógenos pueden mezclarse durante la replicación viral. El genoma de la XEC contiene fragmentos de los genomas de los linajes KS.1.1 y KP.3.3. Además, el linaje presenta mutaciones adicionales que podrían favorecer su propagación.